Community Ecology - Ekologie společenstev

The course will start with three days in the field - we will be accommodated at the administration of protected area in Vysny (Sept 19-21), where we will do some sampling of communities and traits. [Already finished, thanks to all participating, I have enjoyed the course a lot.] For completing the course, you have to participate in data analyses during practicals, present a presentation on an interesting topic of Community Ecology at the concluding seminar (see the presentations from previous runs at the bottom of the page), and finaly, there is an oral exam. You can select either of the tutors (but both of them will ask questions not only from their own lectures, but also of the other tutor). Participation in the field part is not absolutely necessary, but is highly recommended.

Here are all data files from Vysny2023 as a zip file

Interesting reading - books demonstrated during the course - Zajímavé čtení (knížky ukazované na přednáškách)

Intended time table of the course in autumn 2023 - we will try to follow, but you never know what might happen, so might be changed if needed.

Zde jsou naše přednášky v ppt - Here are the presentations used during lectures - sometimes in two mutations, Czech and English - if there are two versions, only the English one is regularly updated.
Úvod a jak měříme diverzitu, determinanty diverzity

Introduction, measures of diversity

Traits in community ecology

Functional Diversity Macro

Functional Diversity Macro info page (incl. manual and paper)

Diversity Determinants

Koexistence druhů ve společenstvu

Species Coexistence

Island biogeography, Diversity on gradients

Phylogenetic analysis of community patterns

Phylogenetic analysis of community patterns - Practicals, prepared by Lars

Potravní sítě - Food webs

Life history and succession

Life history and succession

Vztah herbivor - rostlina: ekologie; Plant - herbivore relationship: ecology

Vztah herbivor - rostlina: evoluce Plant - herbivore relationship: evolution

Parasites

Beta diversity

Ochrana přírody - Nature conservation

Parazitic Plants in plant communities

Diverzita na gradientech prostředí

Diverzita a fungování společenstev

Diversity and ecosystem functioning

Diversity and ecosystem functioning - discussion version1

Diversity and ecosystem functioning - discussion version short

Program of your presentations for the final seminars 2021 (check for free slots before you select your date). Note, that there are either titles, or informal names of the topic if you sent them.

Timetable of the talks

Your presentations for the final seminars 2021 as zip files - Note, the presentations are there as they were rpesented, without any further editing.
Presentations from the first two weeks (as a single zip)

Presentations for the final seminars in 2019

Presentations from the first three sessions 2019, without any corresctions, just as they were delivered, in one .zip file

Materials collected during the field course in Blansky les 2017

All the data as .zip file

Materials collected during the field course in Blansky les

Light trap data - Excel file

Light trap data - Canoco5 project

Sweep net data - Excel file

Species-area -9incl. species vs. no of individuals - Statistica project

PointQadrat etc.

Frequency quadrat

Your presentations for the final seminars 2017 (as delivered, I have done no corrections

Lobsang Tsering: Mangrove

Jhonny Capichoni Massante: High level processes in community ecology

Your presentations for the final seminars

From 2015 - the first week (all in one lagre zip file)

From 2015 - the second week (all in one lagre zip file)

From 2013 (all in one lagre zip file)

Materiály ke cvičením - Materials for practicals - will be updated and provided in English

Data na funkční diverzitu - Ohrazení

Program na pocitani Rarefaction

Originální stránka programu je zde

Community Analysis

Phylogeny practicals

Kokořínsko, souhrný soubor s různými daty

Čtverec 50 x 50 cm

Species area na druhé louce

Program Past

Pozor, program Past je vytvořen pro výpočty na základě počtu individuí. POkud máte data o biomase, některé hodnoty nedávají smysl (Menhinick richness, MArgalef richness, FIsher alpha), a jiné jsou počítány po zaokrouhlování na celá čísla. Zaokrouhlování se dá obejít tak, že biomasy (jako v příkladech) pokud jsou na tři desetinná místa, vynásobíme tisícem (a máme je v miligramech místo v gramech).

Ohrazeni biomasy - xls

Ohrazeni biomasy - space delimited

Ohrazeni - design pokusu - xls

Složení společenstev druhů podčeledi Typhlocybinae z čeledi Cicadellidae, což jsou křísi co vysávají jednotlivé buňky listového mezenchymu, data z PNG, budou použita na rarefaction (pocházejí ze tří míst, do 20 km vzdálených). Všechny vzorky jsou sebrány z druhu Ficus conocephalifolia

zde jsou data

a takhle vypdají Typhlocybinae

PNG data - Latex, hmyzaci a fylogeneze Moraceae

zip file Comp46_local.zip

Ondřej Mudrák - diverzita a fungování společenstev

Anna Vlachovská - dispersal limitation

Katka Nováková - Hostitelská specializace herbivorního hmyzu

Tereza Žába Lamošová - Prostorové uspořádání a fungování společenstev

Jana Krčilová - poloparaziti ve společenstvech

Jan Michálek - PEG model planktonní dynamiky

Eva Tetíková - Species coextinction

Eva Chaloupecká - Regenerační nika

Jan Hrček - Jak mravenci ovlivňují společenstva

Pavel Sova - Species pool limitation u mechorostů

Tady jsou referáty studentů z roku 2007/8 - ppt, jak je dodali, nekorigované (někde vám chybí jméno a já si nejsem jistý, čí to je, přihlaste se, já to tam dopíšu)

Jan Lechner - Rostliny a hmyz

Lukáš Drag - Biodiverzita

Ecology of ants

Jan Mareš - Perifyton

Jan Klečka - Species abundance patterns

Alex Bernardová - Odolnost mediteránních šneků vůči ohni

Jakub Těšitel - Hemiparazitní rostliny

Jak si rostliny pomáhají

Kateřina Štajerová - Arbuskulární mykorhziní symbióza

Jana Bubníková - Rhinanthus, hemiparaziti etc.

Lukáš Sekerka - Býti herbivor a nebýt sežrán

Lenka Bulíčková - C4 rostliny ve společenstvech